根据近期发布的2020年版《中文核心期刊要目总览》，《北京工业大学学报》（自然科学版）成功入选综合性理工农医类核心期刊。这是《北京工业大学学报》（自然科学版）连续8次入选《中文核心期刊要目总览》。《中文核心期刊要目总览》是由北京大学图书馆及北京十几所高校图书馆众多期刊工作者及相关单位专家参与编撰的中文核心期刊评价研究项目成果，自1992年起，已出版了9版，为图书情报部门对中文学术期刊进行评估与订购及读者导读提供了参考依据。

此前，《北京工业大学学报》（自然科学版）也入选了 “中国科技核心期刊”（中国科技论文统计源期刊）。根据发布数据显示，近年来，《北京工业大学学报》（自然科学版）的核心影响因子显著提升，由2015年的0.271提升到2019年的0.710。“中国科技核心期刊”（中国科技论文统计源期刊）是中国科学技术信息研究所承担的“中国科技论文统计与分析”工作的研究成果，受科技管理部门和学术界广泛关注和应用。